我校的水生生物学教学可追溯到1921年，当时水产养殖科的课程中包含了浮游动植物、底栖生物、植物和鱼类等教学内容。1952年全国高等学校院系调整，成立了上海水产学院。同年，学校在国内率先设立了水生生物学专业，当年招收四年制本科生44 名。文革期间停办，1988年恢复招生时，专业名称改为“生物学（水生生物）”。1998年教育部颁布新的本科专业目录设置，专业名称更改为“生物科学”。

专业创办的早期，学校邀请了多名外单位著名学者来校授课，如复旦大学的谈家桢教授和黄文几教授，上海第一医学院的包鼎成老师，中国科学院水生生物研究所的倪达书教授、陈启鎏教授、王德铭教授和尹文英教授等。同时，本校的著名学者朱元鼎（一级教授）、陈子英（二级教授）、王以康（三级教授）、华汝成（三级教授）、陆桂、肖树旭、林新濯、孟庆闻、缪学祖、伍汉霖、苏锦祥、金鑫波、殷名称、梁象秋、王嘉宇、严生良、杨和荃、方纪祖等教授曾长期在本专业任教。据不完全统计，自上世纪60年代以来，约有60位来自越南、日本、英国、法国、美国、巴西，以及我国台湾、香港和大陆的鱼类学家曾在本专业进修，其中包括郑文莲、郑慈英、梅庭安（越南）、宋佳坤等著名教授。

我校的水生生物学于1996年获得生物学二级学科的硕士点，2005年成为博士学位授予点。2011年和2012年，以水生生物学硕士点和博士点为基础，分别申报成功为生物学一级学科的硕士点和博士点。60年的发展，已经形成了本科、硕士和博士专业完整的人才培养体系。

目前，生物科学的本科、硕士和博士专业均由hjc888黄金城老品牌的水生生物系托管，这个系现有的16名教师均具有博士学位，其中教授6名，副教授5名，讲师5名；4名为博士生导师，11名是硕士生导师，师资力量浓厚。

在我校2010-2020年学校发展定位规划中，将海洋学类、水产学类和食品科学类专业建设作为重点发展目标，而生物科学是这些学科专业体系的一类专业和主要支撑学科。因此，生物科学不仅是我校目前的国家特色专业，也是学校构建海洋、水产、食品三大学科专业体系的主要依托学科和专业之一，在上海海洋大学的学科建设和专业发展中具有重要地位。

本专业的发展目标，将依据学校的整体专业布局，本着“厚基础、宽口径、重能力、强特色”的教学理念，提升教学设备条件和师资水平，抓特色课程和教材建设，完善课程体系，着力培养具有海洋特色的创新性和应用型人才,也为我国海洋、水产、食品等方面的人才培养和科技创新提供重要基地。